Свою трудовую деятельность она начала в 2003 году в качестве юриста-консультанта ОАО. Затем работала секретарем заседания Таганрогского городского суда Ростовской области, помощником судьи в этом же суде. До нового назначения Екатерина Серегина была мировым судьей Таганрогского судебного района на судебном участке № 2.
Всего указом Президента РФ в Ростовской области назначили восемь новых судей.
